差分

この文書の現在のバージョンと選択したバージョンの差分を表示します。

この比較画面にリンクする

分子シミュレーション関連:gromacs:エラー対策 [2019/07/01 09:49] (現在)
mumeiyamibito 作成
ライン 1: ライン 1:
 +====== エラー対策 ======
 +===== Water molecule starting at atom N can not be settled =====
 +  * 【原因】配置した水分子の初期位置が悪く、最適化がうまくできない場合に起こる。
 +  * 【対策】''​emstep''​ の値を変えてみる (0.02、0.03、... と徐々に上げてみる)。
 +  * 参考サイト:​ [[https://​www.researchgate.net/​post/​Water_molecule_starting_at_atom_14394_can_not_be_settled-GROMACS | Read 7 answers by scientists with 2 recommendations from their colleagues to the question asked by Manasa Surakala on Nov 22, 2016]]
  
 +
 +
 +
 +{{tag>​Linux 分子シミュレーション アプリケーション}}
  • 分子シミュレーション関連/gromacs/エラー対策.txt
  • 最終更新: 2019/07/01 09:49
  • by mumeiyamibito